Su destino sería el Clube Desportivo de Tondela de la Liga NOS de Portugal, donde milita el capitán de la Selección Nacional de Costa Rica, Bryan Ruiz, y más recientemente el ex compañero de Flores, David Ramírez, quien fichó bajo condición de préstamo con el Moreirense Futebol Clube a finales del mes anterior.
Flores estaría vistiendo su tercera camiseta como futbolista profesional, luego de que debutara en la segunda categoría en el 2014 con la desaparecida filial del Saprissa. Posteriormente y ese mismo año, el delantero sería cedido al Club Sport Uruguay y regresaría a San Juan de Tibás un año más tarde.
De confirmarse su venta, los morados habrían colocado a tres jugadores en el balompié europeo en el presente mercado de fichajes (junto a David Ramírez y Mynor Escoe), además de reportar once salidas tras finalizar terceros en el Campeonato Nacional de Verano Banco Popular 2016.